Presso il Dipartimento di Scienze Umane e Sociali sono attivi due corsi di Dottorato. Per entrambi, la sede amministrativa è l’Università degli studi di Bergamo:

1. Scienze della persona e nuovo welfare 
2. Studi umanistici transculturali

Fino al XXXV ciclo, è stato attivo il corso di Dottorato: Formazione della persona e mercato del lavoro.